Die anaerobe Reinigung von Abwasser und Klärschlamm erfolgt u.a. in Faultürmen und wird aus Gründen der Energieeinsparung besonders von Industriebetrieben angewandt, insbesondere für organisch stark verschmutzte Abwässer. Das bei dem Faulungsprozess entstehende Gas (Biogas) kann zum Heizen verwendet werden.

Liegt hingegen zumindest ungelöst gebundener Sauerstoff vor, handelt es sich um ein anoxisches Milieu. Liegt gelöster Sauerstoff vor, ist das System aerob.